Eleonora var portugisisk prinsesse, idet hun var datter af kong Alphons, som var bror til Valdemar Sejrs anden hustru, Beringera. Hun blev gift med Valdemar den Unge i 1229, da han vendte hjem fra sit fangenskab hos Grev Henrik af Schwerin. Hun led af knoglekræft og døde allerede to år efter brylluppet i barselssengen.

Eleonora er begravet i Sankt Bendts Kirke